とらりもん - Rによる統計解析 Diff
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!作成者
*2009/04/18 桑田 賢太郎 Ubuntu対応
*2015/10/19 牧野 悠(情報が古かったので全面的に書き換え)
!Rとは
Rは、オープンソースの統計解析ソフトです。参考書には『統計学:Rを用いた入門書』(Michael J.Crawley著、野間口謙太郎・菊池泰樹訳)などがあります。
!インストール
[[こちら|http://www.trifields.jp/install-r-in-ubuntu-1000]]を参考にしました。
!!前準備
端末を起動し(ショートカットキー: Ctrl+Alt+t)、以下のコマンドを実行。
$ cat /etc/lsb-release
すると、Ubuntuのバージョンが確認できる。
例
DISTRIB_ID=Ubuntu
DISTRIB_RELEASE=14.04
DISTRIB_CODENAME=trusty
DISTRIB_DESCRIPTION="Ubuntu 14.04.3 LTS"
次に、ミラーサイトの一覧「[[CRAN Mirrors|https://cran.r-project.org]]」で現在利用できるミラーサイトを確認する。2015年10月19日現在、日本国内では以下の2つが利用可能。どちらでもよい。
http://cran.ism.ac.jp/ Institute of Statistical Mathematics, Tokyo
http://ftp.yz.yamagata-u.ac.jp/pub/cran/ Yamagata University
!!実際のインストール作業
端末上で
$ sudo vim /etc/apt/sources.list
エディタが開いたら、上記のUbuntuのバージョンの確認を元に、それにあった次の一行を最後に追加する。
#DISTRIB_CODENAME=vividの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu vivid/
#DISTRIB_CODENAME=trustyの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu trusty/
#DISTRIB_CODENAME=preciseの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu precise/
#DISTRIB_CODENAME=lucidの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu lucid/
次に、公開鍵を登録するため、以下のコマンドを実行する。
$ gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key E084DAB9
すると、以下のように表示される。
gpg: requesting key E084DAB9 from hkp server keyserver.ubuntu.com
gpg: /home/haruka/.gnupg/trustdb.gpg: trustdb created
gpg: key E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported
gpg: Total number processed: 1
gpg: imported: 1 (RSA: 1)
続けて
$ gpg -a --export E084DAB9 | sudo apt-key add -
すると、以下のようにOKが出るはず。
OK
Ubuntuのパッケージを更新し、Rをインストール!
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base
すると
After this operation, 99.8 MB of additional disk space will be used.
Do you want to continue? [Y/n]
当然y。
WARNING: The following packages cannot be authenticated!
r-base-core r-cran-boot r-cran-cluster r-cran-foreign r-cran-mass
r-cran-kernsmooth r-cran-lattice r-cran-nlme r-cran-matrix r-cran-mgcv
r-cran-survival r-cran-rpart r-cran-class r-cran-nnet r-cran-spatial
r-cran-codetools r-recommended r-base r-base-dev r-doc-html r-base-html
Install these packages without verification? [y/N]
まだ何か聞いてくる。これもy。これで完了!
Rを起動するには、以下のコマンドを実行すればよい。
$ R
*2009/04/18 桑田 賢太郎 Ubuntu対応
*2015/10/19 牧野 悠(情報が古かったので全面的に書き換え)
!Rとは
Rは、オープンソースの統計解析ソフトです。参考書には『統計学:Rを用いた入門書』(Michael J.Crawley著、野間口謙太郎・菊池泰樹訳)などがあります。
!インストール
[[こちら|http://www.trifields.jp/install-r-in-ubuntu-1000]]を参考にしました。
!!前準備
端末を起動し
$ cat /etc/lsb-release
すると、Ubuntuのバージョンが確認できる。
例
DISTRIB_ID=Ubuntu
DISTRIB_RELEASE=14.04
DISTRIB_CODENAME=trusty
DISTRIB_DESCRIPTION="Ubuntu 14.04.3 LTS"
次に、ミラーサイトの一覧「[[CRAN Mirrors|https://cran.r-project.org]]」で現在利用できるミラーサイトを確認する。2015年10月19日現在、日本国内では以下の2つが利用可能。どちらでもよい。
http://cran.ism.ac.jp/ Institute of Statistical Mathematics, Tokyo
http://ftp.yz.yamagata-u.ac.jp/pub/cran/ Yamagata University
!!実際のインストール作業
端末上で
$ sudo vim /etc/apt/sources.list
エディタが開いたら、上記のUbuntuのバージョンの確認を元に、それにあった次の一行を最後に追加する。
#DISTRIB_CODENAME=vividの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu vivid/
#DISTRIB_CODENAME=trustyの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu trusty/
#DISTRIB_CODENAME=preciseの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu precise/
#DISTRIB_CODENAME=lucidの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu lucid/
次に、公開鍵を登録するため、以下のコマンドを実行する。
$ gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key E084DAB9
すると、以下のように表示される。
gpg: requesting key E084DAB9 from hkp server keyserver.ubuntu.com
gpg: /home/haruka/.gnupg/trustdb.gpg: trustdb created
gpg: key E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported
gpg: Total number processed: 1
gpg: imported: 1 (RSA: 1)
続けて
$ gpg -a --export E084DAB9 | sudo apt-key add -
すると、以下のようにOKが出るはず。
OK
Ubuntuのパッケージを更新し、Rをインストール!
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base
すると
After this operation, 99.8 MB of additional disk space will be used.
Do you want to continue? [Y/n]
当然y。
WARNING: The following packages cannot be authenticated!
r-base-core r-cran-boot r-cran-cluster r-cran-foreign r-cran-mass
r-cran-kernsmooth r-cran-lattice r-cran-nlme r-cran-matrix r-cran-mgcv
r-cran-survival r-cran-rpart r-cran-class r-cran-nnet r-cran-spatial
r-cran-codetools r-recommended r-base r-base-dev r-doc-html r-base-html
Install these packages without verification? [y/N]
まだ何か聞いてくる。これもy。これで完了!
Rを起動するには、以下のコマンドを実行すればよい。
$ R