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とらりもん - 環境省日本植生図について Diff

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2006/02/18 改訂 筑波大学農林工学系 西田顕郎

2011/11/30 移設  筑波大学 田中健太郎

!環境省日本植生図について (自然環境保全基礎調査 3次メッシュ植生データ)

[[このデータ|http://www.biodic.go.jp/kiso/vg/vg_kiso.html]]は、日本の植生分布として定評のあるものだが、独得のフォーマットをしているので、簡単に読みこむことはできない。以下のような特徴がある:

*カラムデータである: ふつう、この種のラスターデータはマトリックス形式だが、このデータは、位置のコードとその場の分類コードを1行とする単位で構成される、カラムのテキストファイル(csv形式)である。
*位置情報の解読が必要: 座標系は、「基準地域メッシュ(第3次地域区画)」と呼ばれるもので、緯度経度直交座標系の上に矩形領域を入れ子にしてコードをつけたものらしい。これは、国土地理院の50m数値地形モデルでも採用されているコードで、国土地理院の50m数値地形モデルに添附されている紙(地図)に、緯度経度とコードの変換の仕方が書いてある。
*ピクセルの縦横が違う: 1ピクセルは約1kmだが、南北方向30秒、東西方向45秒と、緯度経度座標系ではやや横長の矩形領域である。
*カテゴリーが厖大: カテゴリー(群落コード)は898もある。それをある程度統合した[[「集約群落コード」|http://www.biodic.go.jp/reports/1-1/hyo/u077_002.html]]にしても326もある。リモセンや陸域物質循環モデルなどの実用には、これらを再統合する必要があろう。下記のtar.gzには私が判断して行なった再統合のテーブルがveg_syuyaku_MOD12.txtとして入っている。

[[GRASS|GRASS GISとは?]]で読むことを前堤にして、いくつかスクリプトとCプログラムを作ったので、興味のある方は参考にされたい(自己責任で!)。利用前に、かならず「生物多様性情報システム上の成果物の取り扱いについて」(環境省)を熟読すること。

[[LC_MEJ_v02.tar.gz|http://pen.envr.tsukuba.ac.jp/~ryuiki_plus/sample_data/lecture_data/LC_MEJ_v02.tar.gz]]

!処理のしかた

0. GRASSを起動。latlon投影のLOCATIONに入る。

1. このファイルをダウンロードする: 
  wget http://ryuiki.envr.tsukuba.ac.jp/~nishida/MEMO/LC_MEJ_v02.tar.gzhttp://pen.envr.tsukuba.ac.jp/~nishida/MEMO/LC_MEJ_v02.tar.gz
2. このファイルを解凍/展開する:
  tar zxvf LC_MEJ_v02.tar.gz
3. ディレクトリ移動
  cd LC_MEJ
4. スクリプトを実行
  ./readme.sh

注: これらの処理は、Linux上で行うことを想定している。WindowsではCygwinなどを使うこと。

注: GRASSを起動しなくてもスクリプトは実行可能。ただしその場合、バイナリラスターデータができるだけ。

注: データそのものは、[[こちら|http://www.biodic.go.jp/dload/mesh_vg.html]]からダウンロード可能。

注: 再集約したあとのカテゴリ(MODIS土地被覆分類:MOD12に準拠。ただし水田を追加)は、以下の通りである:

# MOD12 Land_Cover_Type_1
# ENF evergreen_needleleaf_forest         1
# EBF evergreen_broadleaf_forest          2
# DNF deciduous_needleleaf_forest         3
# DBF deciduous_broadleaf_forest          4
# MXF mixed_forests                       5
# CSH closed_shrubland                    6
# OSH open_shrublands                     7
# WSV woody_savannas                      8
# SVN savannas                            9
# GRS grasslands                         10
# PWT permanent_wetlands                 11
# CRP croplands                          12
# URB urban_and_built-up                 13
# MOS cropland_natural_vegetation_mosaic 14
# ICE snow_and_ice                       15
# BAR barren_or_sparsely_vegetated       16
# paddy field (not in MOD12)            253
# UNC unclassified                      254

{{attach_view(LC_MEJ.jpg)}}

GRASSで表示した、自然環境保全基礎調査 3次メッシュ植生データ(MODIS土地被覆分類のカテゴリーに再集約)